Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms