Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prkrip1Q9CWV6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prkrip1Q9CWV6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms