Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms