Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Sec61bQ9CQS8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Sec61bQ9CQS8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Sec61bQ9CQS8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Sec61bQ9CQS8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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