Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl27Q99N92 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl27Q99N92 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms