Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms