Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atg5Q99J83 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atg5Q99J83 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms