Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Sf3b3Q921M3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3b3Q921M3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms