Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Slc6a20aQ8VDB9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Slc6a20aQ8VDB9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Slc6a20aQ8VDB9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Slc6a20aQ8VDB9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Slc6a20aQ8VDB9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Slc6a20aQ8VDB9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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