Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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