Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ercc8Q8CFD5 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ercc8Q8CFD5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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