Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
TtpaQ8BWP5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
TtpaQ8BWP5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms