Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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ChfrQ810L3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ChfrQ810L3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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