Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pcsk9Q80W65 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pcsk9Q80W65 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pcsk9Q80W65 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pcsk9Q80W65 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pcsk9Q80W65 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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