Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrc2aQ7TSC1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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