Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rph3alQ768S4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rph3alQ768S4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rph3alQ768S4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rph3alQ768S4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rph3alQ768S4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rph3alQ768S4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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