Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sh3rf1Q69ZI1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sh3rf1Q69ZI1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sh3rf1Q69ZI1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Sh3rf1Q69ZI1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3rf1Q69ZI1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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