Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc18Q640L5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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