Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PrkciQ62074 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms