Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Phox2aQ62066 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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