Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sin3aQ60520 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms