Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tns3Q5SSZ5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tns3Q5SSZ5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms