Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms