Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
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