Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gtf3c3Q3TMP1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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