Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cpne9Q1RLL3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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