Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Traf3ip1Q149C2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Traf3ip1Q149C2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3ip1Q149C2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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