Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem52bQ0VBF2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms