Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MitfQ08874 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MitfQ08874 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 657.8 ms