Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cnn1Q08091 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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