Protein–RNA interactions for Protein: Q08048

Hgf, Hepatocyte growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfQ08048 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
HgfQ08048 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms