Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec23aQ01405 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sec23aQ01405 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sec23aQ01405 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sec23aQ01405 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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