Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Apoa1Q00623 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms