Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxd13P70217 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Hoxd13P70217 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxd13P70217 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxd13P70217 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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