Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Snrpd1P62315 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snrpd1P62315 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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