Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rps11P62281 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rps11P62281 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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