Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lrch1P62046 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms