Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfia3P60469 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ppfia3P60469 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms