Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csrnp1P59054 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms