Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp5P56399 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms