Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LtbrP50284 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms