Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Psen1P49769 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms