Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tnfsf9P41274 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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