Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp4P35123 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp4P35123 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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