Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U2af2P26369 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
U2af2P26369 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms