Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd12P23812 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms