Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxb4P10284 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms