Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxd3P09027 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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