Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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H2-Eb1P04230 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
H2-Eb1P04230 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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