Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sdc4O35988 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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